Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCNN1AP37088 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1AP37088 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms