Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 TSR1YDL060W 2367 nt3.63□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 MIG1YGL035C 1515 nt3.63□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 URA2YJL130C 6645 nt3.63□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GPI13YLL031C 3054 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 FUN12YAL035W 3009 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 ENT3YJR125C 1227 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 CCE1YKL011C 1062 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 TEM1YML064C 738 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 ECM13YBL043W 774 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GRX7YBR014C 612 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 MCT1YOR221C 1083 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YOR366WYOR366W 354 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 PPT2YPL148C 522 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 ATP20YPR020W 348 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 PBP2YBR233W 1242 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 PRM15YMR278W 1869 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YGL176CYGL176C 1665 nt3.62□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GWT1YJL091C 1473 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YCR085WYCR085W 354 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 PHM6YDR281C 315 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 PMI40YER003C 1290 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YIL161WYIL161W 708 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 CUP9YPL177C 921 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 CBP6YBR120C 489 nt3.61□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 SEC6YIL068C 2418 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 FAP7YDL166C 594 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GPP2YER062C 753 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 COG7YGL005C 840 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YGL152CYGL152C 678 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YGR064WYGR064W 369 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 EST3YIL009C-A 546 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YKE4YIL023C 1041 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 CDC5YMR001C 2118 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 SAS5YOR213C 747 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 RRP36YOR287C 903 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 snR17asnR17a 333 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GPI1YGR216C 1830 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GCD2YGR083C 1956 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 TFB2YPL122C 1542 nt3.6□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 DPP1YDR284C 870 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 GUK1YDR454C 564 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YFL065CYFL065C 309 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 MTC3YGL226W 372 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 PTI1YGR156W 1278 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 THP2YHR167W 786 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 YJR037WYJR037W 384 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 IMP1YMR150C 573 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.59□□□□□ -1.83
YBL055CP34220 SLM2YNL047C 1971 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 snR83snR83 306 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YDR340WYDR340W 303 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 ERJ5YFR041C 888 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YGR114CYGR114C 390 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 EPT1YHR123W 1176 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RAD33YML011C 534 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RCE1YMR274C 948 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 MIC27YNL100W 705 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RFC3YNL290W 1023 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PEX15YOL044W 1152 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YPL035CYPL035C 348 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 NEM1YHR004C 1341 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 MDN1YLR106C 14733 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 SYT1YPR095C 3681 nt3.58□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 THR4YCR053W 1545 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 GPM2YDL021W 936 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 TLG1YDR468C 675 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RSC1YGR056W 2787 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RNT1YMR239C 1416 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YOR238WYOR238W 912 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 BMS1YPL217C 3552 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YBR287WYBR287W 1284 nt3.57□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 WHI3YNL197C 1986 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 NUP60YAR002W 1620 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PKP2YGL059W 1476 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 APM3YBR288C 1452 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PDS1YDR113C 1122 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YDR491CYDR491C 492 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YEA4YEL004W 1029 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 BCD1YHR040W 1101 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RPL22AYLR061W 366 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 REH1YLR387C 1299 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 CIN2YPL241C 807 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YPR136CYPR136C 513 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 SNT1YCR033W 3681 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PKH1YDR490C 2301 nt3.56□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PHO5YBR093C 1404 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RNR1YER070W 2667 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 SEC27YGL137W 2670 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RPS14AYCR031C 414 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 RPL13AYDL082W 600 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PET100YDR079W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 LRS4YDR439W 1044 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 PEF1YGR058W 1008 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 IKI1YHR187W 930 nt3.55□□□□□ -1.84
YBL055CP34220 YIR014WYIR014W 729 nt3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.4 ms