Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSP1P33241 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSP1P33241 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LSP1P33241 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSP1P33241 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSP1P33241 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSP1P33241 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSP1P33241 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LSP1P33241 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSP1P33241 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSP1P33241 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSP1P33241 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms