Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A1P32418 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms