Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3AP31941 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms