Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA6P31267 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms