Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC27P30260 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC27P30260 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC27P30260 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC27P30260 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC27P30260 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms