Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCKSP29966 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MARCKSP29966 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSP29966 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms