Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms