Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMBRP28336 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMBRP28336 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMBRP28336 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMBRP28336 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NMBRP28336 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMBRP28336 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NMBRP28336 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBRP28336 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBRP28336 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBRP28336 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBRP28336 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMBRP28336 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMBRP28336 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMBRP28336 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMBRP28336 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMBRP28336 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NMBRP28336 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NMBRP28336 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBRP28336 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBRP28336 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBRP28336 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMBRP28336 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NMBRP28336 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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