Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA2P26232 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms