Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2AP24928 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms