Protein–RNA interactions for Protein: P22079

LPO, Lactoperoxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPOP22079 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPOP22079 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPOP22079 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPOP22079 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LPOP22079 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPOP22079 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPOP22079 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LPOP22079 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LPOP22079 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LPOP22079 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LPOP22079 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms