Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDCP20941 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDCP20941 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCP20941 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCP20941 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCP20941 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCP20941 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCP20941 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCP20941 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCP20941 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms