Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASTP20810 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASTP20810 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASTP20810 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CASTP20810 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASTP20810 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASTP20810 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASTP20810 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASTP20810 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASTP20810 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASTP20810 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms