Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms