Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC9A1P19634 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A1P19634 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A1P19634 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A1P19634 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A1P19634 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms