Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF6P18850 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF6P18850 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF6P18850 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF6P18850 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF6P18850 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF6P18850 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF6P18850 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF6P18850 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF6P18850 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms