Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL17P18621 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL17P18621 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL17P18621 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL17P18621 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL17P18621 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL17P18621 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL17P18621 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL17P18621 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL17P18621 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms