Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF4P18085 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF4P18085 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF4P18085 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF4P18085 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF4P18085 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARF4P18085 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms