Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN1P18031 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN1P18031 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms