Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms