Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPBP14678 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms