Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM27P14373 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM27P14373 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms