Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCP1P13796 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCP1P13796 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCP1P13796 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCP1P13796 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LCP1P13796 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCP1P13796 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCP1P13796 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCP1P13796 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCP1P13796 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCP1P13796 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms