Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A3P13637 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A3P13637 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms