Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD8P13378 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms