Protein–RNA interactions for Protein: P12724

RNASE3, Eosinophil cationic protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE3P12724 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNASE3P12724 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNASE3P12724 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms