Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFHP12036 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFHP12036 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFHP12036 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms