Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODC1P11926 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODC1P11926 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ODC1P11926 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ODC1P11926 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODC1P11926 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODC1P11926 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ODC1P11926 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODC1P11926 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODC1P11926 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODC1P11926 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ODC1P11926 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODC1P11926 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ODC1P11926 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms