Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms