Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms