Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC192P0DO97 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC192P0DO97 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC192P0DO97 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC192P0DO97 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC192P0DO97 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC192P0DO97 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms