Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2CP0DJJ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms