Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD1P0DJD0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGPD1P0DJD0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms