Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2BP0C7M4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2BP0C7M4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms