Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC175P0C221 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms