Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTAP09496 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTAP09496 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTAP09496 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTAP09496 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTAP09496 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTAP09496 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTAP09496 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLTAP09496 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTAP09496 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTAP09496 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTAP09496 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms