Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA1P09110 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms