Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPSAP08865 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPSAP08865 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPSAP08865 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPSAP08865 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPSAP08865 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPSAP08865 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPSAP08865 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPSAP08865 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPSAP08865 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPSAP08865 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPSAP08865 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPSAP08865 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPSAP08865 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms