Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSP90AB1P08238 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms