Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC3A2P08195 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC3A2P08195 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms