Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI1P08151 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI1P08151 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI1P08151 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLI1P08151 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI1P08151 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI1P08151 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLI1P08151 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLI1P08151 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI1P08151 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms