Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NGFRP08138 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NGFRP08138 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NGFRP08138 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NGFRP08138 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms