Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYCNP04198 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYCNP04198 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYCNP04198 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYCNP04198 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYCNP04198 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYCNP04198 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms