Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HLA-AP01891 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-AP01891 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms