Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOSP01100 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSP01100 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSP01100 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSP01100 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSP01100 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSP01100 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSP01100 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSP01100 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSP01100 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSP01100 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSP01100 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSP01100 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSP01100 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSP01100 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSP01100 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms