Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD3O95983 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD3O95983 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD3O95983 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD3O95983 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD3O95983 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD3O95983 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD3O95983 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms