Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN13O95857 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TSPAN13O95857 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms