Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
STAMBPO95630 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
STAMBPO95630 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms